Trong Boruto, Làng Lá đang đối diện với nhiều mối nguy hiểm từ các nhân vật phản diện mạnh mẽ.
Sau khi Isshiki Otsutsuki bị đánh bại, Làng Lá vẫn đối mặt với hàng loạt mối đe dọa lớn. Hiện tại, họ phải đối mặt với Code, một kẻ thù khủng khiếp của tổ chức Kara.
Mặc dù Code không sánh kịp Kawaki, nhưng Code không phải là kẻ tầm thường. Trong chương mới nhất, Boruto và Kawaki bị áp đảo bởi Code.
Delta là một trong những thành viên mạnh nhất của tổ chức Kara. Cơ thể của Delta đã được cải tạo bằng công nghệ khoa học.

Delta vẫn chưa chết hoàn toàn. Nếu Amado kích hoạt lại Delta, cô sẽ gieo rắc mối đe dọa lớn cho Làng Lá.
Daemon

Daemon là một trong những tạo vật của Amado. Với sức mạnh vượt trội, Daemon là mối đe dọa lớn khác ngoài Code.
Eid

Tương tự như Daemon, Eida là một người máy được Amado tạo ra. Với khả năng đặc biệt, Eida có thể nhìn thấy quá khứ và tương lai, trở thành mối đe dọa lớn đối với Naruto, Sasuke và Boruto.
Kawaki

Boruto phải chiến đấu với Kawaki trong tương lai, khiến Làng Lá đối mặt với nguy cơ. Dù thay đổi, Kawaki vẫn có thể khiến thế giới shinobi hỗn loạn.
Momoshiki Otsutsuki

Ngay từ khi mới xuất hiện, Momoshiki Otsutsuki đã tỏ ra mạnh mẽ đáng kinh ngạc, sở hữu sức mạnh thần thánh khó đối phó. Dù bị đánh bại nhờ sự hợp tác của Naruto, Sasuke và Boruto, Momoshiki vẫn sống bên trong Boruto, đe dọa Làng Lá và Boruto.