Mặc dù là ninja mạnh nhất thế giới, nhưng Naruto cũng phải đối mặt với những nhẫn thuật mà anh không thể sử dụng được.
Trong Boruto, Sarada - con gái của Sasuke, luôn ngưỡng mộ Naruto như một vị Hokage hoàn hảo. Nhưng sự thực lại không như vậy. Bởi vì không phải điều gì ngài đệ thất cũng làm được, thậm chí có những nhẫn thuật mà Naruto không thể sử dụng hoặc sử dụng kém.
Dưới đây là 5 ví dụ:
1. Kỹ thuật Ảo thuật

Kỹ thuật Ảo thuật (Genjutsu) là những phương pháp mà ninja sử dụng để ảnh hưởng đến dòng chảy chakra trong não của đối thủ, khiến họ không thể phân biệt giữa thực và ảo.
Tự nhiên, kỹ năng Ảo thuật không phải là điểm mạnh của Naruto. Anh không phải là kiểu chiến binh sử dụng Ảo thuật để đối đầu với kẻ thù của mình. Vì vậy, Naruto chưa từng học Ảo thuật, có thể nói là anh không có tài năng trong loại nhẫn thuật này.
2. Kỹ thuật Mắt

Kỹ thuật Mắt (Dojutsu) là khả năng di truyền mà ninja sử dụng đôi mắt, cho phép họ cảm nhận được chakra theo nhiều cách khác nhau.
Trong gia tộc Uzumaki hiện tại, mọi thành viên đều sở hữu kỹ năng Mắt ngoại trừ Naruto. Điều này hoàn toàn phụ thuộc vào yếu tố di truyền và may mắn, vì vậy rõ ràng đây không phải là một vấn đề quá lớn. Naruto là một trong những nhân vật mạnh mẽ không sử dụng kỹ năng Mắt.
3. Kỹ thuật Phong ấn

Naruto không phải là người không thể sử dụng kỹ thuật này, mà chỉ là anh không tập trung phát triển những khả năng đặc biệt của gia tộc mình. Tuy vậy, Naruto vẫn sử dụng kỹ thuật phong ấn trong một số tình huống mặc dù là hiếm.
Anh từng áp dụng phong ấn Torri để kiềm chế Kurama bên trong cơ thể mình. Ngoài ra, khi sử dụng chakra Shukaku, anh cũng có thể sử dụng Rasengan để phong ấn.
4. Y học ninja

Trong Boruto đã tiết lộ rằng, Naruto hoàn toàn không thể thực hiện các kỹ thuật y tế. Điều này là hoàn toàn bình thường vì Naruto chưa từng học và không tập trung vào lĩnh vực này.
Khi có được sức mạnh của Lục Đạo Tiên Nhân Hagoromo Otsutsuki, Naruto có thể hoàn toàn sử dụng Âm - Dương độn. Nhờ đó, anh đã cứu Guy khỏi tay tử thần khi mở cổng số 8 trong Bát Môn Độn Giáp và giúp Kakashi khôi phục lại con mắt đã bị Madara cướp mất.
5. Bukijutsu

Thực tế, trong suốt thời gian Naruto chiến đấu, anh thường chỉ ưa thích đánh đấm bằng tay không mà thôi.
