Dù là một trong những nhân vật phức tạp nhất trong Naruto Shippuden, cốt truyện của Pain vẫn còn nhiều điểm chưa rõ mà chính tác giả vẫn chưa giải thích được.
Pain (Nagato Uzumaki) là một nhân vật phức tạp và thú vị trong tác phẩm Naruto, rất được người hâm mộ yêu thích bên cạnh những nhân vật chính. Nhưng cách xây dựng cốt truyện của Pain từ tác giả vẫn còn nhiều điểm chưa thỏa mãn, gây khó chịu và tò mò cho người hâm mộ.
Vai trò của Obito trong câu chuyện
Pain được giới thiệu là một nhân vật cực kỳ mạnh mẽ, thông minh và nhạy bén. Tuy nhiên, anh thường xuyên bị Obito thao túng, mặc dù có trí tuệ và sức mạnh của mình. Nagato không thể nhận ra âm mưu của Obito, kẻ đứng đằng sau giật dây vì lợi ích cá nhân.
Pain không chống lại Danzo
Pain từng có mối thù sâu đậm với Hanzo, đỉnh điểm là cái chết của ông ta. Nhưng Pain chưa từng chống lại Danzo Shimura, dù hắn ta góp phần lớn vào cái chết của Yahiko. Sự không chống lại Danzo, dù biết rõ tội lỗi của hắn, tạo ra mâu thuẫn với những hành vi khác của Pain trong Naruto Shippuden.
Đi theo bước chân của người trước
Kế hoạch hòa bình của Pain là thu thập toàn bộ Vĩ Thú và dùng chúng để áp đặt hòa bình thông qua nỗi sợ. Cách này tương tự như nỗ lực trước đây của Hashirama.
Hashirama đã thu thập Vĩ Thú và phân bố chúng giữa các ngôi làng để duy trì cân bằng quyền lực. Tuy nhiên, kế hoạch này thất bại và gây ra ba cuộc chiến Shinobi. Pain đã bỏ qua diễn biến lịch sử và tiếp tục đi theo bước chân người trước.
Không thể tấn công Konoha khi Làng Lá yếu nhất
Khi Hokage Đệ Tam qua đời, Konoha ở trong tình trạng dễ bị tấn công hơn bao giờ hết. Tuy nhiên, Pain lại không tận dụng cơ hội này để tấn công Làng Lá và bắt Cửu Vĩ cũng như Naruto. Đây có thể là sai lầm chiến lược của Pain trong việc thực hiện kế hoạch tấn công.
Không hồi sinh Yahiko được
Nagato có khả năng đảo ngược cái chết với Rinnegan, nhưng anh không dùng sức mạnh này để hồi sinh bạn thân nhất Yahiko. Theo Konan, Yahiko có thể đã được cứu sống nếu Nagato sử dụng Rinnegan kịp thời.