Mặc dù đã tích hợp SSD, Mac Pro vẫn có cổng SATA để kết nối với ổ đĩa, và một số loại ổ cứng gặp sự cố kết nối do lỗi phần mềm.
Theo thông báo của Apple: “Một số loại ổ cứng SATA có thể tự động ngắt kết nối sau khi máy Mac của bạn khởi động lại. Điều này có thể xảy ra khi Mac tự động chuyển sang chế độ ngủ hoặc nếu bạn thủ công đặt máy Mac vào chế độ ngủ. Nếu bạn nhận thấy thông báo ổ cứng không được tháo ra đúng cách, hãy khởi động lại máy Mac để kết nối lại với ổ cứng.”
Trong thời gian chờ đợi sự khắc phục từ Apple, người dùng có thể ngăn chặn Mac Pro tự động chuyển sang chế độ ngủ bằng cách vào Cài đặt -> Màn hình -> Nâng cao và kích hoạt tính năng ngăn chặn máy tính vào chế độ ngủ khi tắt.
