Sau 6 tháng điều tra và nghiên cứu hơn 1.300 trang báo cáo và hồ sơ khiếu nại, một nhóm nghị sỹ tại Brazil đã đưa ra đề nghị truy tố Tổng thống Bolsonaro với 9 tội danh. Trong số đó, một trong những tội danh nghiêm trọng nhất là tội phạm chống lại nhân loại, khi ông được cáo buộc cố ý thả nổi tình trạng lây lan virus trên diện rộng, nhằm mục đích đạt được miễn dịch cộng đồng. Tổng số người bị đề nghị truy tố là 77 người, trong đó có các quan chức chính phủ, 3 người con trai của tổng thống và 1 số công ty cũng như cá nhân khác.
Theo đó ông tổng thống và nhiều thành viên chính phủ đã có những hành động như không khuyến khích người dân đeo khẩu trang, bỏ qua các lời đề nghị mua vaccine từ sớm và có hành động kêu gọi sử dụng các dạng thuốc chưa được phê chuẩn dù trước đó đã có nhiều bằng chứng khẳng định dạng thuốc đó không có hiệu quả trên người bệnh. Chính việc này được cho là đã dẫn tới hơn 600 nghìn cái chết vì covid tại Brazil, đưa nước này trở thành nước có số ca tử vong cao thứ 2 trên thế giới chỉ sau Mỹ.Bản báo cáo đã được gửi lên tòa án tối cao của Brazil, chờ quyết định về việc truy tố ông Bolsonaro và các liên quan. Đây là quyết định không dễ dàng, cần phiếu thuận từ Hạ viện. Ngoài việc yêu cầu luận tội, số nghị sỹ còn đề nghị cấm tổng thống tham gia mạng xã hội để ngăn thông tin sai lệch. Đặc biệt, sau khi phát ngôn trên mạng livestream rằng tiêm vaccine tăng nguy cơ nhiễm HIV, video này đã bị gỡ bỏ vì vi phạm tiêu chuẩn cộng đồng.
Văn phòng tổng thống chưa đưa ra phản ứng chính thức, trong khi cựu tổng thống Mỹ Donald Trump đã lên tiếng ủng hộ ông Bolsonaro. Ông Trump cho rằng Brazil may mắn khi có một người như ông Bolsonaro lãnh đạo trong giai đoạn này.