1. Siêu đạo chích Kid
Siêu đạo chích Kid là một tên trộm chuyên cướp đá quý, kim cương, và có tuổi đời gần giống với Kudo Shinichi. Theo câu chuyện trong Magic Kaito, Kid là con trai của nhà ảo thuật nổi tiếng Kuroba Toichi. Sau khi cha anh bị tổ chức áo đen (có thể là cùng một tổ chức trong Conan) ám hại, Kaito quyết định biến mình thành Kid, mong tìm ra kẻ đứng sau cái chết của cha mình.
Tuy nhiên, liệu Kid có thực sự là kẻ đứng đầu tổ chức áo đen? Liệu cái chết của cha anh có ẩn chứa điều gì đó chưa được sáng tỏ, hay có thể không phải tổ chức áo đen đứng sau mọi chuyện? Tất cả vẫn chỉ là những giả thuyết chưa được xác minh.

2. Haibara
Nhiều độc giả phỏng đoán rằng ông trùm của tổ chức áo đen có thể đã ở độ tuổi ngoài 50. Tuy nhiên, thân phận và hành động của Haibara đôi khi lại khiến mọi người phải nghi ngờ. Đầu tiên, cha mẹ cô là những người phát minh ra thuốc teo nhỏ. Thứ hai, cô cũng bị teo nhỏ vào thời điểm Conan gặp phải tình trạng tương tự và đã được đưa về sống cùng tiến sỹ Agasa, học chung lớp với Conan, luôn luôn ở bên cậu ấy.
Không thể phủ nhận rằng Haibara sở hữu trí tuệ vượt trội, thông minh đỉnh cao, thuộc hàng đầu. Những nghi vấn về cô gái bí ẩn này vẫn làm nhiều độc giả tò mò. Liệu có thể ông trùm là một phụ nữ, thậm chí còn đang ở độ tuổi cấp ba không nhỉ?

3. Sera
Cô gái tóc ngắn có vẻ ngoài nam tính này là bạn thân của Ran Mori, vì thế cô thường xuyên lui tới và có mối quan hệ thân thiết với đội thám tử nhí. Mặc dù chỉ là một học sinh nữ cấp ba, Sera lại toát lên vẻ bí ẩn, giống như ngoài mặt chỉ là vỏ bọc che giấu diện mạo thật sự của cô vậy.
Có nhiều điều khiến người ta phải hoài nghi về Sera, chẳng hạn như: cô có nghiên cứu về các dự án liên quan đến một tổ chức gián điệp, sở hữu kiến thức sâu rộng về Lực lượng Cảnh sát Nhật Bản, là một bậc thầy võ thuật, và đặc biệt, tuổi tác của cô chưa bao giờ được tiết lộ trong câu chuyện.

4. Vermonth
Cô là một người phụ nữ xinh đẹp, trước đây nổi danh trong giới giải trí với tên tuổi Sharon Vineyard, nhưng hiện tại, cô lại mang danh nữ diễn viên trẻ và là con gái của Chris Vineyard. Vậy thật sự cô diễn viên Chris hiện đang ở đâu? Và làm sao Sharon Vineyard lại có thể trẻ hóa đến thế?
Kể từ khi gia nhập tổ chức áo đen, cô đã chọn biệt danh Vermonth và sống dưới vỏ bọc một người phụ nữ bí ẩn, câu nói nổi tiếng của cô là: "A secret makes a woman woman".

5. Bourbon

6. Mizurashi Rena

7. Subaru Okiya
Subaru thường uống bourbon whisky, điều này khiến anh trở thành đối tượng tình nghi liên quan đến tổ chức áo đen vì liên tưởng đến nhân vật chủ chốt Bourbon. Tuy nhiên, ở các tập gần đây, sự thật đã được tiết lộ rằng Subaru chính là Akai, người đã bị cho là đã chết dưới tay Rena.

8. Tiến sỹ Agasa
Tên đầy đủ của ông là Hiroshi Agasa, là hàng xóm của Shinichi và là người đầu tiên phát hiện ra thân phận thật của cậu bé Edogawa Conan, chính là Kudo Shinichi. Mặc dù là một ông bác hiền lành, luôn sáng chế những thiết bị hỗ trợ đội thám tử nhí trong các vụ án, nhưng những phát minh mà ông làm sau khi làm việc một mình trong phòng nghiên cứu chưa bao giờ được tiết lộ trong truyện.
Nhiều người cho rằng ông là người đứng đầu thực sự của tổ chức áo đen, tuy nhiên điều này vẫn chưa được xác nhận. Trước khi có thông báo chính thức, tất cả vẫn chỉ là những suy đoán từ phía người hâm mộ.

9. Thám tử Mori
Ông thám tử nghiệp dư này chính là "bố vợ tương lai" của Kudo Shinichi. Mặc dù là một thám tử, nhưng thứ duy nhất mà ông quan tâm lại là rượu, phụ nữ và đua ngựa. Tuy nhiên, bạn đã bao giờ tự hỏi tại sao trong những vụ án mà Conan phá, lấy danh nghĩa của Mori khi ông ta bất tỉnh, Mori lại chẳng hề nghi ngờ gì?
Ngay cả một thám tử nghiệp dư cũng có thể nhận thấy sự vô lý trong cách thức phá án của mình và tự hỏi liệu có ai đó đang giúp đỡ một cách bí mật. Tuy nhiên, Mori vẫn thản nhiên cho rằng mình thực sự là một thiên tài phá án ngay cả khi ngủ gật. Liệu đây có phải là một chiêu trò gì đó mà Mori đang âm thầm tính toán? Câu hỏi về nhân vật này vẫn còn là một ẩn số chờ được giải đáp.

10. Bố của Conan- Yusaku Kudo
Mặc dù có vẻ khó tin, nhưng thái độ bình thản, không chút lo lắng của Yusaku khi biết rằng con trai mình đã bị teo nhỏ và đang đối đầu với một tổ chức nguy hiểm thực sự gây ra không ít nghi vấn.
Ông là một trong những người thông minh nhất trong câu chuyện, với IQ và khả năng suy luận logic xuất sắc. Nếu muốn, Yusaku hoàn toàn có thể giúp Shinichi tìm ra tổ chức áo đen, nhưng ông chỉ xuất hiện trong vài vụ án mà không hề can thiệp vào chuyện của tổ chức bí ẩn này. Đặc biệt, mẹ của Shinichi còn có mối quan hệ thân thiết với Vermonth, một thành viên trong tổ chức áo đen. Quả thật, điều này khiến người ta phải nghi ngờ.

